lenti-sgRNA(MS2)-CoGFP-Puro
产品基本信息
| 产品名称 | lenti-sgRNA(MS2)-CoGFP-Puro | ||
| 质粒全程 | lenti-U6-sgRNA(MS2)-EF1a-CoGFP-Puro | ||
| 种类 | CRISPRa/i表达质粒 | 启动子 | U6 |
| 拷贝数 | 高 | 筛选抗性 | Puro |
| 培养温度 | 37°C | 原核抗性 | Amp+ |
| 培养菌株 | Stbl3 | 荧光 | CoGFP |
骨架载体应用用途
lenti-sgRNA(MS2)-CoGFP-Puro是在lenti sgRNA(MS2)_zeo backbone(Addgene #61427)的基础上,改造,增加了CoGFP荧光和Puro抗性,开发的第三代慢病毒sgRNA克隆骨架,专为CRISPR协同激活介导系统(Synergistic Activation Mediator,SAM)设计。核心特征是在sgRNA支架的Tetraloop和Stem loop 2两个位置插入了MS2 RNA发夹适配体,使其能够招募MS2-P65-HSF1转录激活复合物,实现目标基因的高效转录激活。质粒携带U6启动子驱动sgRNA表达,EF1A启动子驱动CoGFP荧光和Puro抗性抗性标记,便于筛选成功转导的细胞。质粒包含BsmBI酶切位点,用于通过Golden Gate克隆法插入20nt的靶向间隔序列。
1.载体构建出库标准是什么?
载体出库默认小提质粒出库,质粒量≥4ug,含甘油菌和穿刺菌。如需要无内毒素质粒提取质粒,我司可提供无内毒素质粒提取业务。
无内毒素质粒中提(A) | 质粒量≥35ug,浓度≥500ng/uL |
无内毒素质粒大提(B) | 无内毒素中提出库是质粒量≥100ug,浓度≥500ng/uL |
无内毒素质粒大提 | 无内毒素大提出库是质粒量≥500ug,浓度大于≥500ng/uL |
2.甘油菌保存方法?
甘油菌50%(v/v)=新鲜菌种:灭菌甘油制备而成,收到甘油菌可直接放-80保存1年
3.甘油菌的复苏方法?
从甘油冻存菌中复苏细菌,在无菌条件下,打开盖子,使用无菌接种环或灭菌枪头从冻存管中取适量冻存菌,划线接种到LB板(含有合适抗生素或无抗)上。操作应适当快一些,以减少冻存管内的融化。在合适的温度条件下,将划线接种的LB板进行过夜培养。过夜培养后,挑取单个克隆进行后续操作。
4.穿刺菌的保存方法?
穿刺菌为无菌枪头取新鲜菌液,然后接种形成穿刺菌,穿刺接种的细菌在温箱中孵育过夜,并在第二天上午检查其是否生长,确保制备的穿刺菌表面上能看到细菌后冰袋邮寄发货。穿刺菌4°C保存时间不超过30d,收到穿刺菌后须在2周内,在含有相应抗生素(抗性信息可在质粒图谱中查看)琼脂平板上划线培养出单菌落,挑取单个克隆进行后续操作。
5.无内毒素质粒提取菌液制备建议方法?
制备起始培养物制备:从甘油菌或者穿刺菌制备的单克隆菌落平板中,挑取新鲜的单克隆菌落,接种于2–5 mL含有相应选择性抗生素的LB培养基中,在37°C下,约300 rpm剧烈振荡培养约8小时(使用的试管或锥形瓶体积应至少为培养物体积的4倍)。
将起始培养物按1/500至1/1000的比例稀释到选择性LB培养基中。在37°C下,约300 rpm剧烈振荡培养12–16小时(使用的锥形瓶或容器体积应至少为培养物体积的4倍)后用商品化的无内毒素质粒试剂盒提取,提取的无内毒素质粒用于后续细胞转染或病毒包装等。
注意:无内毒素提取的质粒建议通过酶切鉴定和测序鉴定与原质粒无差异后进行后续实验。避免质粒提取或菌液接种过程所引起的菌液交叉污染。
9.测序结果原始文件用什么打开?
测序结果原始文件可以用 Snapgene 软件,DNAman分析软件等进行分析。
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